| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ｴﾉｯｸｵﾑﾜﾝﾊﾞ 長崎 | MHPS | 3'45"33 | |
| 2 | 井上 弘也(3) 兵庫 | 上武大学 | 3'45"65 | |
| 3 | 的野 遼大 長崎 | MHPS | 3'46"65 | |
| 4 | 遠藤 清也 山形 | NDｿﾌﾄ | 3'49"40 | |
| 5 | 大西 毅彦 京都 | ｱﾗﾀﾌﾟﾛｼﾞｪｸﾄ | 3'49"53 | |
| 6 | 中西 蓮(3) 和歌山 | 鹿屋体育大学 | 3'52"15 | |
| 7 | 田母神一善(1) 福島 | 中央大学 | 3'53"15 | |
| 8 | 大西 洋彰 京都 | ｱﾗﾀﾌﾟﾛｼﾞｪｸﾄ | 3'54"25 | |
| 9 | 妻藤 圭祐(4) 兵庫 | 九州大学 | 3'55"80 | |
| 10 | 中野 弘章 鹿児島 | NTC | 3'56"77 |